患者取左侧屈膝卧位，臀部垫吸水性尿布垫，将测压导管润滑后插入肛管约6cm。

肛管静息压、括约肌功能长度（肛管高压带区）、肛管最大收缩压、肛管模拟排便迟缓反射、直肠肛管收缩反射、直肠肛管抑制反射、肛管舒张压、直肠感觉阈值、直肠最大耐受量和直肠顺应性等。

肛瘘的外口在肛门周围或臀部的任何部位，它是皮肤上的小凹陷或是小隆起，中央有过度生长的肉芽外翻，外口周围皮肤常因受到刺激有颜色改变和脱皮。病期长、瘢痕大的管道，在肛门周围及臀部皮下可触及索条状改变，有的则不清楚。

如脓汁稠厚而多，表明有急性炎症；血性分泌物，表明脓肿破溃不久。脓水清稀或呈米泔水样分泌物，伴有瘘口凹陷，可能有结核杆菌感染；脓液色黄而臭，多属大肠杆菌感染；混有绿色脓汁，表示有绿脓杆菌混合感染；分泌物黏白如胶冻样，或呈咖啡样血性分泌物，可能有恶性改变。

新生瘘管，外口常无增生结节；时间久后外口可有肉芽组织的突起，或纤维化的结节；一般炎症性外口有结节形成，结核性瘘口出现不规则的凹陷。

复杂性肛瘘尤其是结核性者，外口周围常有褐色圆晕。如管道区皮肤呈现弥漫的暗褐色，或变化的皮色间有正常皮色，具有明显或暗淡的褐色圆晕时，其皮下常有空腔，腔隙可为单个或几个，呈蜂窝样。

触诊对肛瘘的诊断至关重要，肛瘘的走行、深浅、内口的部位以及管道与括约肌的关系均靠指诊获得。根据局部视诊的发现进行触摸，注意局部组织有无不对称的热度增高。若局部温度上升，表示深部有炎症的存在。