诊断肛周脓肿主要通过临床症状、专科检查、辅助检查（血常规、肛周或直肠腔内超声、核磁等）确诊，但需与肛周毛囊炎、疖肿、骶骨前畸胎瘤、肛周急性坏死性筋膜炎相鉴别。

肛周脓肿不是自限性疾病，患肛周脓肿后不会自愈，如不予治疗可发展为肛瘘。目前治疗肛周脓肿有效的方式是手术。

肛周脓肿经保守治疗多数无法得到根治，手术治疗为目前较可靠的根治方法。

如长时间未得到根治，肛周脓肿将发展为肛瘘，慢性肛瘘有癌变风险.

针对肛周脓肿，目前手术方式主要有两种：肛周脓肿单纯切开引流术和肛周脓肿切开引流根治术。医生会根据肛周脓肿分类、严重程度以及全身是否有其他基础疾病，选择适合病情的手术方式。

如无明显手术禁忌证，肛周脓肿诊断明确后一般宜尽早手术，如选择“择期”手术可能导致感染加重、手术切口变大，甚至出现败血症、脓毒血症等危重症。

术前常规需要做的检查有：血常规＋血型、生化、凝血功能、传染病筛查、尿常规、大便常规及潜血、胸部X线片、腹部超声、心电图检查等，其他检查根据患者具体病情选择。