在生活中有许多疾病，各种各样的疾病都有它的治疗方法，肛瘘同样如此，但是需要注意，并不是越先进的技术就是越好的治疗方式，好的治疗方法是要根据患者的病情来制定的。

切开瘘管并将瘘骨壁全部切除至健康组织，创面不于缝合；若创面较大，可部分缝合，部分敞开，填入油纱布，使创口由底向外生长至愈合。适用于低位单纯性肛瘘。

2.挂线疗法

利用橡皮筋或有腐蚀作用的药线的机械性压迫作用，缓慢切开肛瘘的方法。适用于距肛门三到五厘米内，有内外口低位或高位单纯性肛瘘，或作为复杂性肛瘘切开、切除的辅助治疗。

适用于早期单纯性肛瘘，采用长效麻醉注射液，对肛瘘局部注射，药液注入肛瘘基底部和周围组织内，手指轻轻按摩。

4.HCPT微创术

由于肛瘘的病灶复杂，所以治疗的关键在于找到内口，切断感染源，同时将感染组织进行清除，从根本上治愈肛瘘。