肛周湿疹的发病机制复杂，多认为是在内因和外因的作用下引起的一种迟发型变态反应，有些往往无明确的过敏原，说明病人反应性的改变，常涉及多方面的因素，有些还不清楚，有待进一步研究。

基本病因

1、内因

（1）体质与遗传：病人具有过敏体质是本病的主要因素，个体素质及健康状况可以导致其对生活和工作环境中的许多物质过敏，有些病人改变环境、经过锻炼、体质增强后，再接受以往刺激因子，可不再发生湿疹，说明湿疹的发生与体质有密切关系。本病与遗传基因也有一定关系，遗传性过敏体质对致病因子有较高的敏感性。

（2）精神因素与自主神经功能紊乱：精神紧张、失眠、焦虑压抑、过度劳累等，常可诱发湿疹，或使症状加重。

（3）消化系统功能障碍：胃肠功能紊乱可造成黏膜的分泌物吸收功能失常，使异性蛋白或过敏原进入体内而发生湿疹。

（4）内分泌紊乱：女性内分泌紊乱，月经不调，糖尿病等也易并发湿疹。

2、外因

包括各种物理和化学因素，例如创伤、摩擦、人造纤维、局部环境的湿热或干燥、尘螨、食物中的鱼虾蟹等。在肛肠专科疾病中，痔、直肠脱垂、肛瘘、肛管上皮缺损、肛门失禁等疾病的分泌物刺激肛门周围皮肤也可引起湿疹。