目前的原因还不那么清楚，有的认为是“小婴儿直肠粘膜娇嫩，局部防御能力薄弱”引起，很多孩子发病于腹泻后，可能是反复肛周皮肤受污染刺激、摩擦损伤所致；另一部分研究认为，婴儿一过性的雄激素分泌增高，导致肛门腺分泌旺盛，若腺管堵塞，可导致感染，继而形成脓肿；还有一部分研究认为小婴儿免疫系统底下，防御机制尚未发育健全，也会导致该病发生。

但上面这些都是假说，还没有很明确的结论，但普遍认为和孩子自身身体条件有关，和家长护理的关系并不大，所以家长们不必过于愧疚，更多精力应该放在怎么给孩子护理好。