纤维结肠镜虽然不能直接对便秘作出诊断，但其重要的价值在于排除大肠器质性疾病，发现肠道炎症、狭窄或肿瘤，活体组织检查可确定病变性质。因为便秘毕竟是一种良性的、多数属于功能性的疾病，在对便秘作出任何诊断和治疗之前，必须排除大肠肿瘤等器质性疾病。

  在行纤维结肠镜检查中可见肠管张力低、蠕动波少，有的可见肠腔轻度扩张。长期服用大黄、番泻叶、芦荟等蒽醌类泻药者，可见黏膜黑变，其颜色从浅褐色至黑色不等。在辨治时，肠黏膜水肿不充血者，多属虚证和寒证；肠黏膜充血发红或有溃疡者多属热证或湿热证，或虚实夹杂证。